Antiviral Activity in Silico of Benzylisoquinoline Alkaloids existing in Berberis lilloana and B. commutata against key Proteins of SARS-Cov-2 Actividad Antiviral in Silico de Alcaloides Bencilisoquinolinas Presentes en Berberis lilloana y B. commutata Contra Proteínas Claves Del SARS-Cov-2

Zígolo, María A. (2021) Antiviral Activity in Silico of Benzylisoquinoline Alkaloids existing in Berberis lilloana and B. commutata against key Proteins of SARS-Cov-2 Actividad Antiviral in Silico de Alcaloides Bencilisoquinolinas Presentes en Berberis lilloana y B. commutata Contra Proteínas Claves Del SARS-Cov-2. Revista Ciencias Naturales, 2 . pp. 1-12. ISSN 2953-5441

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Resumen

El SARS-CoV-2, una nueva cepa de coronavirus identificada en Wuhan, China, en 2019, ha estado amenazando la salud pública en todo el mundo. El objetivo de este trabajo fue estudiar compuestos alcaloides de protoberberina de origen vegetal como potenciales inhibidores del SARS-CoV-2 mediante estudios de acoplamiento. Se emplearon como dianas moleculares tres proteínas claves del SARS�CoV-2, recientemente cristalizadas: la glicoproteína de pico (S), la proteasa principal (Mpro) y la ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp). El acoplamiento molecular se realizó mediante AutoDock, con el Algoritmo Genético Lamarckiano, para analizar la probabilidad de acoplamiento. Los mejores valores de energías de unión para la proteína S fueron, en kcal / mol: -10,67 para jatrorrizina, -9,65 para berberina y -9,22 para 5,6-dihidroconstrictosina. Para Mpro fueron, en kcal/mol: -10,15 para 5,6-dihidroconstrictosina, -9,86 para jatrorrizina y -8,48 para berberubina. Para RdRp fueron, en kcal / mol: -9.04 para berlambina, -8.99 para canadina, y -8.90 para berberina. Se identificaron enlaces de hidrógeno claves e interacciones hidrofóbicas entre algunos de los alcaloides de protoberberina y las respectivas proteínas virales. De estos resultados surge que estos alcaloides podrían ser potencialmente útiles como fármacos antivirales a ser evaluados experimentalmente contra COVID-19.

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